作。1982年，實行經濟責任制，此后得到不斷完善補充，一直沿襲到今天。同年黃蓮素、仙鶴草等當時的當家產品生產二十一年后被取消。以芳酸、環酸為代表的新的產品群崛起；
1984年，企業的人財物、產供銷由國家統管變為自產自銷、自主經營后，企業第一次萌生了市場觀念，伴隨擴大企業自主權，推行厂長負責制，利改稅，兩權分离，承包等一系列經濟体制改革，催生了企業活力；
1986 年到 1995 年間，質量、品种、效益成為這一時期的主線， 企業不斷探索現代化管理方法，大力推進新產品開發，創造了“內涵制約法”、“邊際利潤法”、“滿負荷生產和目標跟蹤法”等管理成果，先后開發了五十多個新產品，使企業生產品种達到160多种。1990年，第一個精神病藥氯丙咪 投產，到今天已發展到二十多個品种，成為了公司的支柱產品。 1992年改革分配制度，打破“大鍋飯”。在此期間，企業先后獲得過湖南醫藥工業“十佳三強”，全國五百家最大醫藥工業企業，湖南省質量管理先進企業，常德市明星企業等稱號；主要產品多次獲省优、部优獎；
1996年，企業被列入全國醫藥系統37家和湖南省55家首批建立現代企業制度試點單位之一，邁開了改制的步伐，同年4月17日，湖南省經貿委与常德市人民政府聯合行文，以湘經貿企函[1996]26號文批准設立湖南洞庭藥業股份有限公司。公司以湖南洞庭制藥厂為主發起人，聯合常德市郵電局、常德市鴻陵通信發展有限責任公司、湖南常德赤峰煤礦、湖南洞庭制藥厂工會共同發起設立，總股本1938万元。 1997年3月26 日在省工商局登記注冊，取得法人營業執照；
1998年，公司增發1900万股，由湘泉集團獨家認購，1999年湘泉集團轉讓股份給酒鬼酒股份有限公司，酒鬼酒股份有限公司（簡稱“湘酒鬼”）成為公司第一大股東；
股份制改造促進了企業快速發展。1998年被評為湖南省优秀企業；2000年被評為湖南省高新技術企業，年產值首次突破億元大關； 2002年全面完成了GMP改造工程，開發成功了第一個二類新藥富馬酸奎硫平，公司的素質和競爭能力明顯增強；2004年銷售回款過億元。目前，公司總股本4403万元，股東為“湘酒鬼”、“常德市國資委”、“常德市郵政局”、“中國高新投資集團公司”、“洞藥工會”。
